Les nanocorps d’alpaga peuvent neutraliser les variantes du coronavirus

Après plus de deux ans de lutte et d’adaptation à la vie avec la COVID-19, le virus à l’origine de cette maladie est toujours parmi nous. Et il semble que cela restera avec nous pendant longtemps. Malgré l’utilisation de vaccins et de traitements antiviraux, des personnes souffrent toujours, voire meurent, d’une grave infection au COVID.

En outre, des millions de personnes dans les pays les plus pauvres n’ont pas encore accès aux vaccins, ce qui les rend plus vulnérables aux effets d’une forme grave de la COVID. Dans cette optique, tout traitement efficace susceptible d’augmenter les chances de survivre à une infection grave est une priorité élevée.

Un domaine d’intérêt a été l’utilisation de nanocorps ou d’anticorps miniatures. Les nanocorps sont comme de petits fragments d’anticorps qui se lient uniquement à une section (domaine) spécifique d’un antigène, telle que la protéine Spike. Ils peuvent immobiliser un virus de cette manière, grâce à leur structure petite et agile qui les rend capables de pénétrer dans les plis et les recoins d’une protéine de pointe virale. Des nanocorps sont produits chez les membres de la famille des chameaux, notamment les lamas, les alpagas et les chameaux, en réponse à une infection par le virus SARS-CoV-2.

Des chercheurs du Karolinska Institutet en Suède ont récemment développé une nouvelle stratégie pour identifier des nanocorps puissants provenant d’alpagas, en particulier, qui sont efficaces contre les variantes émergentes du SRAS-CoV-2. Ils ont identifié plusieurs nanocorps différents et les ont testés dans des cultures cellulaires et chez des souris vivantes, pour savoir s’ils bloquaient l’infection par différentes variantes du virus SARS-CoV-2. Les résultats sont rapportés dans deux publications – une dans un passé récent en Communications naturelles et l’autre, aujourd’hui, à Avancées scientifiques.

« Grâce à des techniques de laboratoire avancées, nous avons pu identifier un panel de nanocorps qui ont neutralisé très efficacement plusieurs variantes du SRAS-CoV-2 », a déclaré le professeur Gerald McInerney, co-auteur principal des deux études.

Malgré le déploiement des vaccins et des antiviraux, les habitants de nombreux pays n’ont toujours pas accès aux traitements anti-COVID dont ils ont besoin. Les nanocorps d’alpagas peuvent être adaptés pour être utilisés chez l’homme et présentent plusieurs avantages par rapport aux traitements et aux anticorps conventionnels. Par exemple, ils sont peu coûteux à produire à grande échelle et possèdent des propriétés biochimiques favorables qui les rendent efficaces dans le traitement de différents virus.

Le premier rapport en Communications naturelles décrit un seul nanocorps, Fu2 (du nom de l’alpaga Funny), qui a considérablement réduit la charge virale du SRAS-CoV-2 dans des cultures cellulaires et des souris vivantes. En utilisant la cryomicroscopie électronique, les chercheurs ont découvert que Fu2 se lie à deux sites distincts de la protéine de pointe virale, inhibant ainsi la capacité du virus à pénétrer dans les cellules hôtes. Cette partie de l’étude a été menée en collaboration avec Hrishikesh Das et Martin Hällberg du Département de biologie cellulaire et moléculaire du Karolinska Institutet.

Dans la phase suivante de l’étude, les chercheurs ont combiné une gamme de techniques de laboratoire et de méthodes informatiques avancées pour évaluer la diversité des nanocorps d’alpaga et découvrir s’ils seraient efficaces contre différentes variantes du virus SARS-CoV-2. Les résultats, présentés aujourd’hui dans Avancées scientifiquesa révélé plusieurs nanocorps supplémentaires qui ont efficacement neutralisé à la fois les variantes initiale et bêta du SRAS-CoV-2 et même le SRAS-CoV-1, plus éloigné.

« Ces nanocorps représentent des candidats thérapeutiques prometteurs contre plusieurs variantes du SRAS-CoV-2 », a déclaré le premier auteur de l’étude, Leo Hanke, chercheur postdoctoral qui a établi la technologie des nanocorps dans le groupe McInerney.

Les chercheurs appliquent actuellement les mêmes techniques pour identifier quels nanocorps de cet ensemble sont les plus capables de neutraliser l’omicron, la variante du SRAS-CoV-2 qui domine actuellement dans de nombreux pays du monde.

« Une fois établies, ces bibliothèques peuvent être étendues et exploitées pour des nanobodies qui neutralisent les nouvelles variantes émergentes », a déclaré le professeur Ben Murrell, également co-auteur principal des deux études.

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Par Alison Bosman, Espèces-menacées.fr Rédacteur