Omicron circule toujours largement dans les populations animales

Le variant Omicron, hautement contagieux et immunitairement évasif, semble s’atténuer rapidement dans de nombreux pays. Aux États-Unis, le nombre de cas a chuté de 66 % au cours des deux dernières semaines et les hospitalisations sont finalement tombées sous la barre des 100 000. De plus, il semble que la sœur d’Omicron, BA.2, ne causera pas beaucoup plus de problèmes que la variante originale, même si elle est légèrement plus contagieuse.

Ces évolutions ont conduit de nombreux États américains à abandonner les mandats de port du masque. Plusieurs pays européens, comme le Danemark ou la Suède, ont levé presque toutes les restrictions liées au COVID-19 pour tenter de revenir à une vie normale – ou plutôt d’apprendre à « vivre avec le virus », comme l’ont récemment fait de nombreux gouvernements, politiciens et responsables de la santé. Mets-le.

Cependant, comme l’a fait valoir Maria Van Kerkhove, responsable technique du COVID-19 à l’Organisation mondiale de la santé, lors d’une mise à jour sur le coronavirus à Genève, les chances pour qu’Omicron soit la dernière variante préoccupante sont minces.

« Nous entendons beaucoup de gens suggérer qu’Omicron est la dernière variante, que c’est fini après cela. Et ce n’est pas le cas car ce virus circule à un niveau très intense dans le monde entier. Ce ne sera pas la dernière variante préoccupante », a déclaré Van Kerkhove.

« Cette pandémie est loin d’être terminée et avec l’incroyable croissance d’Omicron à l’échelle mondiale, de nouveaux variants sont susceptibles d’émerger, c’est pourquoi le suivi et l’évaluation restent essentiels », a confirmé le directeur général de l’OMS, Tedros Adhanom Ghebreysus.

Outre la possibilité qu’Omicron puisse muter en une variante plus pathogène en infectant un hôte humain, de nombreux scientifiques préviennent qu’il pourrait également trouver des réservoirs animaux dans lesquels il pourrait muter vers des formes encore plus imprévisibles, puis se propager chez l’homme.

En fait, une étude récente publiée dans le Journal de génétique et génomique a fait valoir qu’un ancêtre d’Omicron (plus proche du virus de type sauvage de Wuhan) aurait pu passer de l’humain à la souris en 2020 dans un processus appelé « zoonose inverse », puis se propager à nouveau chez l’humain sous une forme fortement mutée vers la fin de l’année. l’année dernière, provoquant les épidémies massives actuelles.

Une autre étude, dirigée par la Pennsylvania State University, a récemment révélé que le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus) sont très sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2. Les scientifiques ont déjà signalé de multiples transmissions du virus depuis les humains vers divers animaux, notamment des cerfs vivant en liberté dans plusieurs endroits des États-Unis. À New York, dans l’Illinois, au Michigan et en Pennsylvanie, par exemple, plus de 40 % de la population de cerfs blancs possède des anticorps contre le coronavirus, ce qui suggère une transmission communautaire massive parmi ces animaux. De plus, des rapports de cerfs infectés commencent également à apparaître au Canada, en Ontario, au Québec et en Saskatchewan.

« Les détections précoces chez les animaux de compagnie, dans les élevages de visons, dans les collections zoologiques – étaient toutes différentes car il s’agissait de populations confinées », a déclaré le Dr Andrew Bowman, épidémiologiste vétérinaire à l’Ohio State University. « Nous n’avions pas vraiment de cadre naturel dans lequel le virus pouvait se propager librement. »

Bien que les infections à coronavirus chez ces animaux semblent être largement asymptomatiques, si le cerf de Virginie devient un réservoir du virus, l’agent pathogène pourrait muter et se propager à d’autres animaux et peut-être même aux humains. « Si le cerf devenait un réservoir de la faune nord-américaine, et nous pensons qu’il court un tel risque, il y aurait de réelles inquiétudes pour la santé des autres espèces sauvages, du bétail, des animaux de compagnie et même des humains », a déclaré le Dr. Casey Barton Behravesh, directeur du One Health Office du Center for Disease Control, qui étudie les liens entre la santé humaine, animale et environnementale.

Selon Stefanie Seifert, experte en maladies zoonotiques à l’Université de l’État de Washington, le cerf de Virginie constitue actuellement une « boîte noire » pour le virus. « Nous savons que le virus a été introduit à plusieurs reprises, nous savons qu’il y a une transmission ultérieure. Mais nous ne savons pas comment le virus s’adapte ni comment il continuera à s’adapter.»

Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour clarifier comment les cerfs attrapent le virus, comment il mute à l’intérieur d’eux et s’il pourrait (ou a déjà été) transmis à d’autres espèces animales sensibles ou de nouveau aux humains. Tant que la circulation du virus entre les différentes espèces ne sera pas strictement contrôlée (et il y a peu de chances maintenant que cela soit possible), la pandémie ne sera probablement pas terminée.

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Par Andreï Ionescu, Espèces-menacées.fr Rédacteur