Le poisson-clown pourrait révéler de nouveaux indices sur l’adaptation au climat

Le poisson-clown charismatique – rendu célèbre par le film populaire Le monde de nemo – est un trésor pour la recherche biologique, aidant les scientifiques à répondre à une myriade de questions biologiques, telles que la façon dont les larves se dispersent en haute mer ou la réaction des poissons des récifs coralliens aux changements induits par le réchauffement climatique. Alors qu’un génome complet du poisson-clown orange – le Nemo original – a été publié il y a quelques années, ce n’est que récemment que les scientifiques ont réussi à séquencer le génome du faux poisson-clown (Amphiprion ocellaris) également, une espèce apparentée trouvée autour d’Okinawa, des Philippines, de l’Asie du Sud-Est et du nord-ouest de l’Australie.

« Ce génome, qui ressemble au modèle du faux poisson-clown, sera une ressource très utile pour les scientifiques de tous les domaines biologiques », a déclaré le co-auteur principal de l’étude, le Dr Marcela Herrera Sarrias, chercheuse postdoctorale à l’Institut des sciences et technologies d’Okinawa. Université supérieure (OIST).

« Nous pouvons utiliser le faux poisson-clown comme espèce modèle pour étudier l’écologie, l’évolution, l’adaptation, la biologie du développement, etc. », a expliqué Vincent Laudet, co-auteur de l’étude et professeur des sciences de la vie et de la santé à l’OIST.

Le faux poisson-clown vit dans les régions tropicales et subtropicales et dépend des anémones de mer des récifs coralliens pour sa survie. Comme dans le cas de nombreux autres poissons des récifs coralliens, leurs populations devraient diminuer à mesure que les récifs coralliens rétrécissent en raison du changement climatique.

Les chercheurs ont collecté de faux poissons-clowns dans les eaux proches d’Onna-son, un village de l’île d’Okinawa, ont extrait des échantillons de leur ADN et de leur ARN et ont cartographié de manière très détaillée leur génome. Ils ont découvert que, comme son cousin orange, le faux poisson-clown appartenait à une sous-famille de poisson clown, composée de 28 espèces de poissons au total. Dans une étape ultérieure, les scientifiques ont comparé les génomes du poisson orange et du faux poisson-clown afin de découvrir quels gènes les deux espèces partageaient mais pourraient manquer chez les 26 autres espèces.

« Du point de vue évolutif, les deux espèces de poissons-clowns sont séparées des 26 autres espèces de la sous-famille », a déclaré le chef du projet, le Dr Taewoo Ryu, expert en génétique des organismes marins à l’OIST. « Nous voulions découvrir ce qui les rend spéciaux. »

Le Dr Ryu et ses collègues ont découvert 70 gènes conservés dans le génome du poisson orange et du faux poisson-clown, mais pas dans les 26 autres espèces. Un sous-ensemble considérable de ces gènes était lié au fonctionnement neurobiologique, affectant ainsi probablement le comportement et l’écologie des deux espèces de poissons-clowns d’une manière qui les différenciait des autres espèces de poisson clown.

« Nous avons déjà commencé à générer des résultats en utilisant le génome publié et il existe une énorme capacité pour poursuivre les recherches sur le changement climatique sur cette espèce », a conclu l’auteur principal de l’étude, Timothy Ravasi, professeur de sciences marines et chercheur principal de l’unité sur le changement climatique marin à OIST. « Cette ressource fournit une nouvelle base pour démarrer d’autres expériences. »

L’étude est publiée dans la revue Gènes G3 | Génomes | La génétique.

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Par Andreï Ionescu, Espèces-menacées.fr Rédacteur