Des scientifiques découvrent au Mexique une « petite armée » de bactéries capables d’aider l’agriculture

Sur les pentes sèches de la Mixteca Alta, où l'érosion a laissé des sillons et des terrasses, un nouveau protagoniste apparaît sous nos pieds. Une équipe de l’Université nationale autonome du Mexique a identifié une véritable « armée » de bactéries du sol susceptibles de restaurer la fertilité des terres et de réduire l’utilisation d’engrais chimiques.

Des scientifiques de l'Unité Académique d'Études Territoriales (UAET) Oaxaca, de l'Institut de Géographie de l'UNAM, ont étudié les sols du Géoparc mondial UNESCO Mixteca Alta et ont trouvé des communautés bactériennes capables d'améliorer le cycle des nutriments, de générer de la matière organique stable, de supprimer les agents pathogènes et de soutenir la restauration écologique des zones agricoles endommagées.

En pratique, cela signifie quelque chose de très simple pour ceux qui vivent de leur parcelle. Des sols qui retiennent mieux l'eau, des plantes qui tombent de moins en moins dépendantes des sacs d'engrais et de pesticides qui rendent chaque campagne plus coûteuse et laissent une empreinte environnementale.

La Mixteca Alta, un ancien champ plein de vie invisible

La découverte a été faite dans trois systèmes agricoles traditionnels de lama bordes, terrasses et vallées que les communautés locales gèrent depuis plus de 3 400 ans dans la Mixteca Alta, reconnue comme géoparc mondial par l'UNESCO.

Et qu’y a-t-il de si spécial dans un domaine travaillé pendant tant de siècles ? Selon l'équipe, ces pratiques ont créé des sols très riches en matière organique et avec des conditions physiques stables, un scénario idéal pour le développement d'une énorme diversité de bactéries bénéfiques. Récupérer une poignée de terre là-bas, ce n’est pas seulement toucher la poussière, c’est entretenir tout un écosystème en miniature.

Bien que les agriculteurs n’aient pas parlé de microbiomes, leur façon de gérer les pentes, l’eau et les restes de cultures a fonctionné comme une technologie ancienne de régénération des sols. Aujourd’hui, la science donne un nom et un prénom à cette vie microscopique qui agissait en silence depuis des siècles.

Qui compose cette « armée » microscopique

Pour savoir qui se trouvait là-bas, l'équipe dirigée par Mario Alberto Martínez Núñez a appliqué les techniques de séquençage du gène de l'ARNr 16S, un outil qui permet d'identifier quelles bactéries se trouvent et dans quelle proportion.

Martínez Núñez lui-même résume la méthodologie comme suit : « Des techniques de séquençage du gène 16S Rrna ont été utilisées pour caractériser les communautés bactériennes présentes dans les sols de trois agrosystèmes traditionnels. »

Les analyses révèlent des groupes bactériens dominants tels que les Protéobactéries, les Actinobactéries, les Acidobactéries et les Chloroflexi, ainsi que des familles telles que les Solibacteraceae, les Sphingomonadaceae et les Gemmatimonadaceae. Derrière ces noms techniques se cachent des fonctions bien précises : décomposer les restes végétaux, former des agrégats qui améliorent la structure du sol, participer au cycle du carbone et de l'azote et aider les racines à mieux accéder aux nutriments.

En parallèle, nombre de ces bactéries agissent comme une défense naturelle contre les champignons et autres agents pathogènes. Au lieu de toujours compter sur des fongicides, le sol lui-même peut faire une grande partie du travail de protection des cultures si son microbiome est sain.

Des données génomiques au biofertilisant local

Avec la carte microbienne en main, les chercheurs indiquent clairement la prochaine étape. En connaissant quelles bactéries sont caractéristiques des lamas bordes, terrasses et vallées de la Mixteca Alta, il est possible de concevoir des biointrants locaux, des biofertilisants et des biostimulants adaptés à ces sols au lieu de produits standards conçus pour n'importe quel endroit du monde.

Pour un agriculteur, cela peut se traduire par moins de dépenses en engrais industriels, en sols qui retiennent mieux l’eau et les nutriments, et en cultures un peu plus résistantes aux sécheresses et aux épisodes extrêmes de plus en plus fréquents. Ce n’est pas de la magie, il s’agit de tirer parti d’une machinerie biologique déjà en place, affinée au fil des siècles.

De plus, la connaissance de ces microbiomes peut servir de guide pour récupérer les zones dégradées. Prendre comme référence les sols les mieux conservés du Géoparc permet de savoir quels types de communautés bactériennes doivent être encouragés lorsque l'on souhaite restaurer une parcelle endommagée par l'érosion ou une gestion intensive.

Science et savoirs locaux ramenant dans la même direction

L’une des clés de ce travail est qu’il ne confronte pas tradition et science, mais qu’il les combine. Les systèmes agricoles ancestraux de la Mixteca Alta ont fonctionné, dans une large mesure, comme une expérience en plein air. La génomique moderne permet désormais de comprendre pourquoi et d’en tirer profit pour concevoir des stratégies d’agriculture durable.

Les auteurs soulignent que la conservation de la biodiversité microbienne d’Oaxaca n’est pas seulement une curiosité scientifique. C'est une ressource stratégique pour innover en biotechnologie, renforcer la fertilité naturelle des sols et positionner le Géoparc comme un modèle d'intégration entre agriculture traditionnelle, écologie et nouvelles technologies.

Il reste des étapes importantes à franchir pour isoler des souches spécifiques, tester les formulations de biofertilisants sur le terrain, ajuster les doses et les combinaisons. Mais le message sous-jacent est clair : le terrain n’est pas vide. Si on en prend soin, elle peut devenir l’un des alliés les plus puissants d’une agriculture plus durable, avec moins de produits chimiques et plus de vie.

La déclaration officielle concernant cette découverte a été publiée dans UNAM mondiale.

L’article Des scientifiques découvrent une « petite armée » de bactéries au Mexique capables d’aider l’agriculture a été publié pour la première fois sur ECOticias.com.