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Des grenouilles que l’on croyait éteintes ont été détectées grâce à l’ADN environnemental

Par Nicolas Guillot | Publié le 16.02.2024 à 21h00 | Modifié le 16.02.2024 à 21h00 | 0 commentaire
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Des scientifiques ont utilisé une nouvelle technique de test d’ADN environnemental au Brésil pour trouver des preuves de l’existence d’une grenouille que l’on croyait éteinte il y a plus de 50 ans. La grenouille, Megaelosia bocainensis, n’a pas été repérée depuis 1968.

L’étude a été conçue pour localiser les espèces en déclin ou disparues dans deux points chauds de la biodiversité au Brésil : la forêt côtière de l’Atlantique et les prairies du Cerrado.

Pour déterminer si certaines espèces peuvent être présentes dans des zones où elles habitaient autrefois, les experts ont utilisé une technique avancée qui consiste à collecter et à filtrer l’ADN environnemental (ADNe). Cette méthode détecte les traces d’ADN laissées par les organismes vivants dans le sol, l’eau et l’air.

Depuis que Megaelosia bocainensis a disparu du Parque Nacional da Serra da Bocaina, au Brésil, elle n’est connue qu’à partir d’un spécimen de musée collecté en 1968. La technique eDNA peut confirmer la présence d’espèces qui ne sont pas détectées à l’aide de méthodes traditionnelles, fournissant ainsi un outil précieux pour les scientifiques en conservation. pour évaluer les espèces menacées.

L’analyse a détecté des signes de Megaelosia bocainensis, ainsi que deux grenouilles présumées localement éteintes et quatre espèces en déclin.

« De petits morceaux d’ADN dans l’environnement ne nous disent pas combien d’individus il y a ou si ces individus sont en bonne santé, mais cela nous indique que l’espèce est toujours présente », a déclaré le professeur Kelly Zamudio, auteur principal de l’étude, de l’Université Cornell.

« Il s’agit d’un autre type de données d’enquête, et pour les espèces en déclin ou localement disparues, cela signifie non seulement qu’elles sont là, mais qu’il est désormais possible de les étudier plus en détail », a-t-elle déclaré, notant que pour de nombreuses espèces, on sait très peu de choses.

L’enquête a ciblé 13 espèces de grenouilles totalement disparues, 12 espèces localement disparues et cinq espèces devenues difficiles à retrouver.

Les chercheurs se sont rendus sur les sites d’échantillonnage et ont collecté de l’eau de ruisseau ou d’étang, en utilisant un filtre spécial pour capturer et préserver l’ADN. En laboratoire, l’ADN a été extrait et séquencé génétiquement. Ils ont éliminé le matériel génétique des humains, des porcs et d’autres organismes jusqu’à avoir isolé tout l’ADN de grenouille.

« Maintenant, vous disposez d’un sous-ensemble de séquences génétiques dont nous savons qu’elles appartiennent uniquement aux grenouilles, puis cela se fait étape par étape, de plus en plus finement, jusqu’à ce que vous arriviez au genre et à l’espèce que vous recherchez », a déclaré le professeur Zamudio.

Même si les scientifiques ne disposaient d’aucun tissu de M. bocainensis pour une comparaison d’ADN, ils disposaient de tissus d’espèces sœurs apparentées.

« Nous savons qu’il y a une Megaelosia là-bas, nous ne savons tout simplement pas de laquelle il s’agit, mais la seule qui ait jamais été signalée là-bas historiquement est celle qui a disparu », a déclaré le professeur Zamudio. « Est-ce qu’on y croit ? C’est jusqu’où l’analyse peut nous mener.

L’étude est publiée dans la revue Écologie moléculaire.

—

Par Chrissy Sexton, Espèces-menacées.fr Rédacteur

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