Un nombre croissant de recherches ont récemment montré que les microbiomes intestinaux des humains et d’autres mammifères sont étonnamment complexes, hébergeant une variété de communautés microbiennes qui peuvent profondément affecter la santé d’un individu.
Dans une nouvelle étude de Université d’État de Caroline du NordCependant, les scientifiques ont découvert que les ours noirs semblent être une exception. Ces animaux hébergent une population microbienne qui est fondamentalement homogène dans tout le tractus intestinal.
« C’est la première espèce de mammifère pour laquelle nous avons examiné deux emplacements distincts dans l’intestin et trouvé des communautés microbiennes essentiellement impossibles à distinguer les unes des autres », a déclaré Sierra Gillman, premier auteur de l’étude.
« Les ours ont des intestins très simples – à peu près un tuyau d’arrosage – ils ne peuvent donc pas réguler leurs microbes intestinaux dans la mesure où les animaux dotés d’intestins plus longs et plus complexes le peuvent », a ajouté le professeur Erin McKenney, co-auteur de l’étude. « Sans ce contrôle, le régime alimentaire et l’environnement des ours pourraient jouer un rôle plus important dans la formation du microbiome intestinal. Cela soulève des questions évolutives intéressantes sur la relation entre la forme de l’intestin d’un animal, son microbiome intestinal, et la relation entre le microbiome et la santé et le comportement de l’animal.
Pour en savoir plus sur le microbiome intestinal des ours noirs américains, les chercheurs ont travaillé avec des guides qui dirigeaient des voyages programmés avec des chasseurs dans la péninsule supérieure du Michigan. Les guides ont été formés sur la manière de prélever des échantillons sur les ours capturés en cours de route.
Gillman a spécifiquement enseigné aux guides comment prélever des échantillons de la partie médiane de l’intestin grêle et du côlon, ou du gros intestin. Les chercheurs ont finalement obtenu 31 échantillons d’intestin grêle et 30 échantillons de gros intestin, qui ont été testés pour identifier les espèces microbiennes présentes.
L’équipe s’attendait à observer une plus grande quantité et une plus grande diversité de microbes dans le gros intestin, où la digestion ralentit généralement et favorise la diversité microbienne. Cependant, il pourrait y avoir une explication évidente à la simplicité des microbiomes intestinaux des ours noirs.
Les omnivores aux intestins plus complexes ont un caecum – une petite poche située entre l’intestin grêle et le gros intestin – qui ralentit la vitesse à laquelle les aliments passent dans l’intestin.
Le caecum pourrait même servir de réservoir pour les populations microbiennes dans l’intestin, ce qui permettrait aux animaux de maintenir la diversité de leurs microbiomes malgré leur régime alimentaire.
« Les ours n’ont pas de caecum », a expliqué Gillman. « Cela rend leur microbiome intestinal plus vulnérable aux changements systémiques dus à l’alimentation, à la santé ou à d’autres facteurs. » Pour les chercheurs sur la faune sauvage, cette découverte a une application immédiate.
« Chez de nombreuses espèces animales, un échantillon fécal peut vous dire à quoi ressemblait la diversité microbienne du côlon, mais il ne vous dit pas grand-chose sur ce qui se passe dans d’autres parties de l’intestin », a déclaré le professeur Diana Lafferty, co-auteur de l’étude.
« Nos travaux suggèrent qu’un échantillon fécal offre un aperçu de la communauté microbienne dans l’ensemble de l’intestin des ours noirs – et éventuellement d’autres carnivores et omnivores qui ont des morphologies intestinales simples. »
Pour déterminer si les résultats sont cohérents d’une région géographique à l’autre, les chercheurs comparent actuellement les échantillons collectés au Michigan à ceux d’ours noirs de Caroline du Nord.
Selon le professeur Lafferty, l’équipe travaille également sur un projet qui contribuera à clarifier les liens entre le microbiome intestinal et la santé des ours.
« L’une des choses qui nous intéresse est la prise de poids », a déclaré McKenney. « Nous savons que des changements spécifiques dans le microbiome peuvent entraîner une prise de poids et l’obésité chez d’autres espèces, ce qui est généralement considéré comme négatif. Mais pour les espèces qui hibernent, comme les ours, cela pourrait en fait être avantageux.
L’étude est publiée dans la revue Rapports scientifiques.
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Par Chrissy Sexton, Espèces-menacées.fr Rédacteur
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